337 ورقة بحثية
تُنشئ هذه الدراسة خريطة تنموية شاملة قائمة على التعبير الجيني في مراحل تكوين الجهاز العصبي المبكرة لدى كائن "سباديلا سيفالوبتيرا" (Spadella cephaloptera) من فصيلة الشعريات، كاشفةً أنه على الرغم من بنيته الفريدة للجهاز العصبي، فإنه يُظهر سمات نمط جزيئي ثنائية التماثل محفوظة، ونشرًا مكانيًا وزمانيًا للجينات المحورية والجينات المكونة للأعصاب الرئيسية.
تقدم هذه الورقة قاعدة بيانات جينومية شاملة ومتاحة للجمهور تحتوي على أكثر من 1,700 جينوم متسلسل لنباتات *Arabidopsis lyrata* و*A. arenosa* ذات التلقيح الخلطي، والتي تدمج بين البنية السكانية، والخرائط الجغرافية، وقدرات دراسة الارتباط على نطاق الجينوم لتسهيل الأبحاث حول التكيف المحلي وعلم الوراثة المقارن.
تقدم الورقة البحثية أداة **scoup**، وهي أداة تعتمد على لغة R ومنصة Bioconductor، تدمج بشكل فريد بين علم تطور السلالات وعلم الوراثة السكانية من خلال محاكاة تسلسلات الكودونات تحت تأثير الانتقاء الدارويني عبر دمج مبتكر بين نموذج "هالبرن-برونو" للطفرات والانتقاء وعملية "أورنستين-أولين" (Ornstein-Uhlenbeck).
تكشف هذه الاستقصاءات الجينومية أن فطر *Clonostachys rosea* يضم سلالات متباينة الجنس (heterothallic) سلفية وأخرى متماثلة الجنس (homothallic) مشتقة، حيث نشأت الأخيرة في أمريكا الجنوبية وتُظهر أنماطاً متميزة من التنوع النوكليوتيدي عدم توازن الارتباط التي تعكس استراتيجيتها التكاثرية ذاتية الإخصاب.
باستخدام نظام تطور تجريبي عالي التكرار لذبابة الفاكهة، تُظهر هذه الدراسة أن الانتخاب من أجل تأجيل التكاثر يدفع نحو تكيفات متعددة الجينات ومتقاربة تعمل على إطالة العمر وتعزيز الدفاع المناعي من خلال تحولات في التردد الأليلي في الجينات المرتبطة أساساً بالنمو العصبي وتخلق الأعضاء بدلاً من مسارات الشيخوخة التقليدية.
من خلال تحليل تكاملي للبيانات الجينومية والأليلية والمورفولوجية، تفكك هذه الدراسة التعقيد التصنيفي لمجموعة "أبيض العين الآسيوي" سريعة الانتشار، كاشفةً عن انقسامات فيلوجينية عميقة وتطوراً مورفولوجياً متميزاً، مع الاستنتاج بأن العديد من الاختلافات الملحوظة بين العشائر، مثل النوع شبه العرقي *Z. montanus*، لا تمثل على الأرجح بعد خطوط أنواع مستقلة تماماً.
كشفت التحليلات الفيلوجينومية باستخدام بيانات الالتقاط المستهدف أن صنوبر نيوزيلندا الجبلي *Podocarpus nivalis* نشأ كهجين بين نوع *P. laetus* النيوزيلندي ونوع *P. lawrencei* الأسترالي، مما يسلط الضضواء على أهمية التطور الشبكي في الصنوبريات في نصف الكرة الجنوبي.
تكشف هذه الدراسة أنه في حين كان تطور متغيرات سارس-كوف-2 المبكرة مدفوعاً بزيادة القدرة على العدوى، فإن موجات الانتخاب اللاحقة كانت مدفوعة بشكل أساسي بالتراكم الإضافي للطفرات التي تعزز الهروب المناعي، مما سمح للسلالات الناجحة بالحفاظ على قدرة عالية على العدوى مع التطور المستمر في الخصائص المستضدية.
من خلال مقارنة النسخ المتماثلة للترانسكريبتوم في الخلايا المفردة لإسفنج "Sycon capricorn" الكلسي مع تلك الموجودة في الإسفنجيات الديموسبونج واللاسعات، تؤكد هذه الدراسة فرضية هايكلل بأن طبقات جسم الإسفنج (الطبقة الخلايا المسامية والطبقة المبطنة) متماثلة مع الطبقات الجرثومية في الحيوانات الحقيقية متعددة الخلايا، مما يضع الإسفنج كخطوة تطورية وسيطة بين الطلائعيات والحيوانات المعقدة.
تقدم هذه الدراسة توصيفاً مورفولوجياً مفصلاً لعملية الانسلاخ في سرطان حذوة الحصان الأطلسي (*Limulus polyphemus*)، مما يضع منهجية غير جراحية لتحديد مراحل التطور مع الكشف عن أن أنماط الانسلاخ لديه تعكس كلاً من الحفظ الفيلوجيني مع غيرها من مخلبيات القدم والتقارب التطوري عبر المفصليات.